Ubicada a una considerable distancia de la costa noroeste de Florida, Watertown sigue siendo vulnerable a los peligros que los huracanes representan. Su relativamente baja elevación y terreno plano la hacen particularmente susceptible a inundaciones durante la temporada de huracanes. La posición geográfica expone a Watertown a riesgos de tormentas tropicales, que suelen traer consigo fuertes lluvias, vientos altos y marejadas. El riesgo de inundaciones en Watertown depende en gran medida de la intensidad de la lluvia durante un evento de tormenta y se ve agravado por la limitada infraestructura de drenaje pluvial de la ciudad. Las prolongadas interrupciones en el suministro eléctrico y daños a la infraestructura son consideraciones adicionales que históricamente han ocurrido como resultado de actividad de huracanes. En los últimos 30 años, Watertown ha enfrentado varios huracanes y eventos de inundación de gran envergadura. De manera notoria, el área experimentó los desastrosos impactos del Huracán Michael en 2018, el cual, a pesar de haber tocado tierra en el oeste del Panhandle, causó significativas lluvias e inundaciones subsecuentes. Otro impacto significativo ocurrió durante la Tormenta Tropical Alberto en 1994, que causó severas inundaciones, resultando en extensos daños a propiedades. A medida que el cambio climático potencialmente intensifica la fuerza y frecuencia de los huracanes, se recomienda que Watertown refuerce la resiliencia de su infraestructura, especialmente el sistema de drenaje pluvial, y promueva entre sus residentes el desarrollo de planes de emergencia y evacuación personal.